Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCCQ00597 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCCQ00597 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms