Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERVK-24P63145 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVK-24P63145 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms