Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113P63132 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms