Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HERVK_113P61574 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms