Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTBP60709 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTBP60709 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTBP60709 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTBP60709 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTBP60709 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTBP60709 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTBP60709 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTBP60709 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTBP60709 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTBP60709 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTBP60709 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTBP60709 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTBP60709 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTBP60709 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTBP60709 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTBP60709 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTBP60709 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTBP60709 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTBP60709 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTBP60709 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTBP60709 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTBP60709 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTBP60709 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTBP60709 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTBP60709 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTBP60709 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTBP60709 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTBP60709 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTBP60709 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTBP60709 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTBP60709 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTBP60709 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTBP60709 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTBP60709 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTBP60709 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTBP60709 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTBP60709 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTBP60709 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTBP60709 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTBP60709 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTBP60709 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTBP60709 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTBP60709 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTBP60709 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTBP60709 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTBP60709 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTBP60709 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTBP60709 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTBP60709 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTBP60709 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTBP60709 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTBP60709 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTBP60709 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTBP60709 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTBP60709 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTBP60709 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTBP60709 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTBP60709 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTBP60709 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTBP60709 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTBP60709 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTBP60709 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTBP60709 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTBP60709 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTBP60709 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTBP60709 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTBP60709 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTBP60709 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTBP60709 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTBP60709 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTBP60709 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTBP60709 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTBP60709 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTBP60709 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTBP60709 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTBP60709 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTBP60709 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTBP60709 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTBP60709 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTBP60709 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTBP60709 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTBP60709 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTBP60709 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTBP60709 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTBP60709 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTBP60709 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTBP60709 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTBP60709 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTBP60709 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTBP60709 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTBP60709 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTBP60709 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTBP60709 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTBP60709 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTBP60709 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTBP60709 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTBP60709 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTBP60709 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACTBP60709 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms