Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC00313P59037 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms