Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELLP55199 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELLP55199 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELLP55199 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELLP55199 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELLP55199 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELLP55199 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELLP55199 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELLP55199 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELLP55199 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ELLP55199 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELLP55199 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELLP55199 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELLP55199 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELLP55199 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELLP55199 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ELLP55199 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELLP55199 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELLP55199 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELLP55199 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELLP55199 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELLP55199 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELLP55199 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELLP55199 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELLP55199 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELLP55199 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELLP55199 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELLP55199 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ELLP55199 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELLP55199 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELLP55199 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELLP55199 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELLP55199 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELLP55199 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELLP55199 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELLP55199 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELLP55199 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELLP55199 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ELLP55199 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELLP55199 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELLP55199 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELLP55199 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELLP55199 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELLP55199 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELLP55199 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELLP55199 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELLP55199 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELLP55199 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELLP55199 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELLP55199 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELLP55199 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ELLP55199 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELLP55199 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELLP55199 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELLP55199 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELLP55199 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELLP55199 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELLP55199 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELLP55199 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELLP55199 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELLP55199 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELLP55199 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELLP55199 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELLP55199 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELLP55199 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ELLP55199 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELLP55199 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELLP55199 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELLP55199 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELLP55199 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELLP55199 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELLP55199 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELLP55199 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELLP55199 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELLP55199 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ELLP55199 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ELLP55199 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ELLP55199 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ELLP55199 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ELLP55199 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ELLP55199 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ELLP55199 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ELLP55199 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ELLP55199 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ELLP55199 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ELLP55199 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ELLP55199 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ELLP55199 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ELLP55199 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ELLP55199 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ELLP55199 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ELLP55199 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ELLP55199 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ELLP55199 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ELLP55199 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ELLP55199 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ELLP55199 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ELLP55199 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ELLP55199 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ELLP55199 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms