Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
PDE6CP51160 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms