Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF6P49848 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF6P49848 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF6P49848 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF6P49848 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF6P49848 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF6P49848 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF6P49848 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF6P49848 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF6P49848 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF6P49848 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF6P49848 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF6P49848 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF6P49848 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF6P49848 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF6P49848 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF6P49848 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF6P49848 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF6P49848 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF6P49848 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF6P49848 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF6P49848 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF6P49848 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF6P49848 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF6P49848 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF6P49848 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF6P49848 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF6P49848 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF6P49848 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF6P49848 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF6P49848 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF6P49848 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF6P49848 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF6P49848 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF6P49848 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF6P49848 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF6P49848 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF6P49848 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF6P49848 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF6P49848 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF6P49848 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF6P49848 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF6P49848 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF6P49848 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF6P49848 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF6P49848 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF6P49848 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF6P49848 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF6P49848 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF6P49848 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF6P49848 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF6P49848 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF6P49848 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF6P49848 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF6P49848 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF6P49848 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF6P49848 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF6P49848 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF6P49848 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF6P49848 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF6P49848 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF6P49848 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF6P49848 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF6P49848 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF6P49848 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF6P49848 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF6P49848 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF6P49848 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF6P49848 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF6P49848 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF6P49848 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF6P49848 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF6P49848 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF6P49848 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF6P49848 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF6P49848 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF6P49848 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF6P49848 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF6P49848 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF6P49848 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF6P49848 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF6P49848 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF6P49848 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF6P49848 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF6P49848 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF6P49848 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF6P49848 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF6P49848 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF6P49848 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TAF6P49848 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TAF6P49848 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TAF6P49848 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF6P49848 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF6P49848 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF6P49848 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF6P49848 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF6P49848 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF6P49848 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF6P49848 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF6P49848 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms