Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP8P40818 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP8P40818 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP8P40818 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP8P40818 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP8P40818 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP8P40818 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP8P40818 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP8P40818 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP8P40818 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP8P40818 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP8P40818 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP8P40818 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP8P40818 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP8P40818 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP8P40818 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP8P40818 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP8P40818 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP8P40818 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP8P40818 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP8P40818 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP8P40818 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP8P40818 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP8P40818 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP8P40818 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP8P40818 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP8P40818 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP8P40818 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP8P40818 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP8P40818 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP8P40818 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP8P40818 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP8P40818 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP8P40818 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP8P40818 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP8P40818 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP8P40818 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP8P40818 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP8P40818 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP8P40818 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP8P40818 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP8P40818 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP8P40818 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP8P40818 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP8P40818 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP8P40818 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP8P40818 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP8P40818 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP8P40818 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP8P40818 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP8P40818 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP8P40818 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP8P40818 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP8P40818 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP8P40818 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP8P40818 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP8P40818 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP8P40818 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP8P40818 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP8P40818 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP8P40818 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP8P40818 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP8P40818 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP8P40818 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP8P40818 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP8P40818 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP8P40818 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP8P40818 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP8P40818 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP8P40818 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP8P40818 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP8P40818 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP8P40818 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP8P40818 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP8P40818 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP8P40818 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP8P40818 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP8P40818 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP8P40818 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP8P40818 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP8P40818 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP8P40818 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP8P40818 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP8P40818 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP8P40818 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP8P40818 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP8P40818 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP8P40818 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP8P40818 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP8P40818 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP8P40818 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP8P40818 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP8P40818 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP8P40818 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP8P40818 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP8P40818 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP8P40818 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP8P40818 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP8P40818 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP8P40818 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms