Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CXCR5P32302 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CXCR5P32302 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms