Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PVALBP20472 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PVALBP20472 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PVALBP20472 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PVALBP20472 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PVALBP20472 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PVALBP20472 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PVALBP20472 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PVALBP20472 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PVALBP20472 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PVALBP20472 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PVALBP20472 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PVALBP20472 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PVALBP20472 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PVALBP20472 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PVALBP20472 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PVALBP20472 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PVALBP20472 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PVALBP20472 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PVALBP20472 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PVALBP20472 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PVALBP20472 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PVALBP20472 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PVALBP20472 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PVALBP20472 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PVALBP20472 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PVALBP20472 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PVALBP20472 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PVALBP20472 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PVALBP20472 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PVALBP20472 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PVALBP20472 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PVALBP20472 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PVALBP20472 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PVALBP20472 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PVALBP20472 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PVALBP20472 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PVALBP20472 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PVALBP20472 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PVALBP20472 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PVALBP20472 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PVALBP20472 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PVALBP20472 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PVALBP20472 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PVALBP20472 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PVALBP20472 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PVALBP20472 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PVALBP20472 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PVALBP20472 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PVALBP20472 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PVALBP20472 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PVALBP20472 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PVALBP20472 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PVALBP20472 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PVALBP20472 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PVALBP20472 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PVALBP20472 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PVALBP20472 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PVALBP20472 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PVALBP20472 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PVALBP20472 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PVALBP20472 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PVALBP20472 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PVALBP20472 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PVALBP20472 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PVALBP20472 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PVALBP20472 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PVALBP20472 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PVALBP20472 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PVALBP20472 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PVALBP20472 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PVALBP20472 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PVALBP20472 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PVALBP20472 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PVALBP20472 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PVALBP20472 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PVALBP20472 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PVALBP20472 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PVALBP20472 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PVALBP20472 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PVALBP20472 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PVALBP20472 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PVALBP20472 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PVALBP20472 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PVALBP20472 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PVALBP20472 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PVALBP20472 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PVALBP20472 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PVALBP20472 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PVALBP20472 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PVALBP20472 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PVALBP20472 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PVALBP20472 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PVALBP20472 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PVALBP20472 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PVALBP20472 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PVALBP20472 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PVALBP20472 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PVALBP20472 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PVALBP20472 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms