Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT15P19012 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT15P19012 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT15P19012 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT15P19012 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT15P19012 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT15P19012 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT15P19012 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRT15P19012 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT15P19012 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT15P19012 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT15P19012 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT15P19012 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT15P19012 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT15P19012 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT15P19012 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT15P19012 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT15P19012 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT15P19012 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT15P19012 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT15P19012 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT15P19012 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT15P19012 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT15P19012 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT15P19012 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRT15P19012 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT15P19012 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT15P19012 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT15P19012 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT15P19012 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT15P19012 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT15P19012 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT15P19012 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT15P19012 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT15P19012 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT15P19012 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRT15P19012 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT15P19012 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT15P19012 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT15P19012 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT15P19012 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT15P19012 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT15P19012 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT15P19012 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT15P19012 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT15P19012 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT15P19012 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT15P19012 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT15P19012 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT15P19012 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT15P19012 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT15P19012 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT15P19012 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT15P19012 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT15P19012 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT15P19012 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KRT15P19012 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT15P19012 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT15P19012 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT15P19012 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT15P19012 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT15P19012 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT15P19012 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT15P19012 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT15P19012 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT15P19012 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT15P19012 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT15P19012 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT15P19012 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KRT15P19012 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT15P19012 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT15P19012 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT15P19012 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT15P19012 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT15P19012 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT15P19012 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT15P19012 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT15P19012 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT15P19012 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT15P19012 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT15P19012 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT15P19012 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT15P19012 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT15P19012 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KRT15P19012 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT15P19012 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT15P19012 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT15P19012 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT15P19012 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT15P19012 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT15P19012 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT15P19012 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT15P19012 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT15P19012 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT15P19012 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT15P19012 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT15P19012 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT15P19012 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT15P19012 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KRT15P19012 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms