Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HKR1P10072 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HKR1P10072 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HKR1P10072 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HKR1P10072 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HKR1P10072 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HKR1P10072 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HKR1P10072 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HKR1P10072 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HKR1P10072 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HKR1P10072 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HKR1P10072 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HKR1P10072 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HKR1P10072 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HKR1P10072 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HKR1P10072 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HKR1P10072 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HKR1P10072 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HKR1P10072 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HKR1P10072 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HKR1P10072 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HKR1P10072 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HKR1P10072 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HKR1P10072 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HKR1P10072 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HKR1P10072 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HKR1P10072 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HKR1P10072 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HKR1P10072 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HKR1P10072 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HKR1P10072 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HKR1P10072 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HKR1P10072 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HKR1P10072 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HKR1P10072 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HKR1P10072 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HKR1P10072 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HKR1P10072 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HKR1P10072 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HKR1P10072 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HKR1P10072 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HKR1P10072 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HKR1P10072 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HKR1P10072 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HKR1P10072 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HKR1P10072 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HKR1P10072 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HKR1P10072 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HKR1P10072 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HKR1P10072 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HKR1P10072 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HKR1P10072 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HKR1P10072 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HKR1P10072 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HKR1P10072 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HKR1P10072 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HKR1P10072 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HKR1P10072 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HKR1P10072 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HKR1P10072 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HKR1P10072 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HKR1P10072 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HKR1P10072 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HKR1P10072 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HKR1P10072 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HKR1P10072 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HKR1P10072 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HKR1P10072 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HKR1P10072 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HKR1P10072 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HKR1P10072 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HKR1P10072 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HKR1P10072 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HKR1P10072 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HKR1P10072 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HKR1P10072 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HKR1P10072 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HKR1P10072 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HKR1P10072 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HKR1P10072 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HKR1P10072 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HKR1P10072 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HKR1P10072 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HKR1P10072 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HKR1P10072 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HKR1P10072 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HKR1P10072 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HKR1P10072 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HKR1P10072 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HKR1P10072 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HKR1P10072 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HKR1P10072 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HKR1P10072 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HKR1P10072 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HKR1P10072 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HKR1P10072 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HKR1P10072 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HKR1P10072 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HKR1P10072 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HKR1P10072 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms