Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RD3LP0DJH9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms