Protein–RNA interactions for Protein: P02462

COL4A1, Collagen alpha-1(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A1P02462 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL4A1P02462 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL4A1P02462 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms