Protein–RNA interactions for Protein: O60543

CIDEA, Cell death activator CIDE-A, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIDEAO60543 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIDEAO60543 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms