Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCM3APO60318 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCM3APO60318 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms