Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSNA1O43805 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms