Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB6O15197 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB6O15197 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms