Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IKBKBO14920 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IKBKBO14920 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IKBKBO14920 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms