Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRDCB7Z8K6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRDCB7Z8K6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms