Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SERINC4A6NH21 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SERINC4A6NH21 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms