Protein–RNA interactions for Protein: A6NDI0

TRIM49B, Putative tripartite motif-containing protein 49B, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49BA6NDI0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM49BA6NDI0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM49BA6NDI0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms