Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 TMA7-202ENST00000477624 619 ntTSL 1 (best)22.4■■□□□ 1.181e-8■■■□□ 15.2
UTP3Q9NQZ2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.771e-8■■■□□ 15.2
UTP3Q9NQZ2 TPR-206ENST00000481347 2727 ntTSL 511.99□□□□□ -0.493e-9■■■□□ 15.2
UTP3Q9NQZ2 SPAG9-216ENST00000513827 728 ntTSL 28.82□□□□□ -16e-6■■■□□ 15.1
UTP3Q9NQZ2 SAMSN1-205ENST00000493640 282 ntTSL 38.18□□□□□ -1.16e-6■■■□□ 15.1
UTP3Q9NQZ2 NCL-203ENST00000417652 568 ntTSL 47.39□□□□□ -1.238e-8■■■□□ 15.1
UTP3Q9NQZ2 NCL-206ENST00000454824 606 ntTSL 37.39□□□□□ -1.238e-8■■■□□ 15.1
UTP3Q9NQZ2 TPR-208ENST00000492973 453 ntTSL 29.86□□□□□ -0.831e-8■■■□□ 15.1
UTP3Q9NQZ2 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.86□□□□□ -1.793e-12■■■□□ 15.1
UTP3Q9NQZ2 RBM39-208ENST00000416108 577 ntTSL 49.03□□□□□ -0.962e-6■■■□□ 15.1
UTP3Q9NQZ2 RBM39-220ENST00000455343 441 ntTSL 55.47□□□□□ -1.532e-6■■■□□ 15.1
UTP3Q9NQZ2 AARS-204ENST00000566969 610 ntTSL 210.6□□□□□ -0.712e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 BCL2L1-205ENST00000422920 1157 ntTSL 226.8■■□□□ 1.886e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.496e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.276e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.976e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 AKAP8L-209ENST00000595879 790 ntTSL 319.96■□□□□ 0.796e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 AKAP8L-212ENST00000596750 906 ntTSL 319.12■□□□□ 0.656e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 BCL2L1-209ENST00000456404 914 ntTSL 218.69■□□□□ 0.586e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.576e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 EXO1-203ENST00000423131 950 ntTSL 517.76■□□□□ 0.436e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.316e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.256e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.166e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.096e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 TAF12-204ENST00000495422 624 ntTSL 514.8□□□□□ -0.046e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.056e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 QPRT-204ENST00000564967 2199 nt14.36□□□□□ -0.116e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 PABPN1-205ENST00000555295 406 ntTSL 313.59□□□□□ -0.231e-10■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 VAT1-206ENST00000589709 570 ntTSL 412.88□□□□□ -0.356e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 BCL2L1-207ENST00000439267 781 ntTSL 212.59□□□□□ -0.396e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 MACF1-212ENST00000469366 460 ntTSL 312.54□□□□□ -0.46e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 NCAPD2-204ENST00000536090 654 ntTSL 212.25□□□□□ -0.456e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 MACF1-217ENST00000480624 642 ntTSL 312.19□□□□□ -0.466e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 CCDC47-206ENST00000584112 588 ntTSL 211.72□□□□□ -0.536e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 PABPN1-203ENST00000553960 817 ntTSL 211.5□□□□□ -0.571e-10■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 BCL2L1-204ENST00000420488 820 ntTSL 211.18□□□□□ -0.626e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 EXO1-202ENST00000366548 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.676e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 AFDN-220ENST00000511503 1257 ntTSL 210.82□□□□□ -0.686e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 MACF1-222ENST00000494012 667 ntTSL 410.65□□□□□ -0.76e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 AFDN-222ENST00000515794 746 ntTSL 310.65□□□□□ -0.76e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 EXO1-210ENST00000519225 583 ntTSL 410.65□□□□□ -0.76e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 PABPN1-208ENST00000557702 778 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.811e-10■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 AFDN-214ENST00000486649 423 ntTSL 29.89□□□□□ -0.836e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.936e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 SGMS1-211ENST00000626236 1013 ntTSL 1 (best)9.18□□□□□ -0.946e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC9.03□□□□□ -0.966e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 AFDN-213ENST00000485634 606 ntTSL 28.98□□□□□ -0.976e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 PGRMC2-202ENST00000394276 2858 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.996e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.056e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 VAT1-207ENST00000589828 521 ntTSL 28.37□□□□□ -1.076e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 TAF12-203ENST00000471683 844 ntTSL 38.2□□□□□ -1.16e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 SGMS1-201ENST00000361543 1096 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.116e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.256e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 EXO1-212ENST00000523590 621 ntTSL 56.63□□□□□ -1.356e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 SGMS1-207ENST00000602619 461 ntTSL 35.38□□□□□ -1.556e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 TXNIP-202ENST00000486597 509 ntTSL 25.08□□□□□ -1.63e-6■■■□□ 14.9
UTP3Q9NQZ2 TMA7-203ENST00000479126 688 ntTSL 222.45■■□□□ 1.181e-8■■■□□ 14.9
UTP3Q9NQZ2 EPB41-211ENST00000488277 262 ntTSL 34.81□□□□□ -1.645e-10■■■□□ 14.9
UTP3Q9NQZ2 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.228e-9■■■□□ 14.8
UTP3Q9NQZ2 HMGB2-205ENST00000511316 1841 ntTSL 213.25□□□□□ -0.298e-9■■■□□ 14.8
UTP3Q9NQZ2 HMGB2-201ENST00000296503 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.348e-9■■■□□ 14.8
UTP3Q9NQZ2 ADH5-210ENST00000512621 1475 ntTSL 213.19□□□□□ -0.35e-8■■■□□ 14.8
UTP3Q9NQZ2 ADH5-212ENST00000512991 880 ntTSL 511.39□□□□□ -0.595e-8■■■□□ 14.8
UTP3Q9NQZ2 ADH5-204ENST00000503130 786 ntTSL 310.43□□□□□ -0.745e-8■■■□□ 14.8
UTP3Q9NQZ2 PDHA1-202ENST00000379804 709 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.065e-8■■■□□ 14.8
UTP3Q9NQZ2 PDHA1-210ENST00000481733 437 ntTSL 27□□□□□ -1.295e-8■■■□□ 14.8
UTP3Q9NQZ2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.41e-6■■■□□ 14.8
UTP3Q9NQZ2 PFN1-202ENST00000572383 539 ntTSL 319.43■□□□□ 0.72e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.632e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-244ENST00000495463 501 ntTSL 430.34■■■□□ 2.459e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-234ENST00000475474 749 ntTSL 227.75■■■□□ 2.039e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-238ENST00000482304 740 ntTSL 226.79■■□□□ 1.889e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-227ENST00000462147 576 ntTSL 426.26■■□□□ 1.799e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-216ENST00000434955 480 ntTSL 324.33■■□□□ 1.499e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-209ENST00000411484 561 ntTSL 423.39■■□□□ 1.339e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-217ENST00000436795 775 ntTSL 523.39■■□□□ 1.339e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-215ENST00000429791 724 ntTSL 423.08■■□□□ 1.299e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-231ENST00000469175 486 ntTSL 322.68■■□□□ 1.229e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-210ENST00000420786 539 ntTSL 521.17■□□□□ 0.989e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-218ENST00000437066 574 ntTSL 418.71■□□□□ 0.599e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-242ENST00000492978 775 ntTSL 318.51■□□□□ 0.559e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-235ENST00000475823 371 ntTSL 311.93□□□□□ -0.59e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-224ENST00000457335 570 ntTSL 411.12□□□□□ -0.639e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-212ENST00000425899 738 ntTSL 511□□□□□ -0.659e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-214ENST00000428524 644 ntTSL 510.7□□□□□ -0.79e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-230ENST00000467971 571 ntTSL 210.23□□□□□ -0.779e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-219ENST00000441533 372 ntTSL 58.55□□□□□ -1.049e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-207ENST00000407017 650 ntTSL 48.06□□□□□ -1.129e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-221ENST00000445030 575 ntTSL 38.06□□□□□ -1.129e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-233ENST00000473479 659 ntTSL 27.59□□□□□ -1.199e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-241ENST00000484740 563 ntTSL 36.67□□□□□ -1.349e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-220ENST00000443492 558 ntTSL 56.37□□□□□ -1.399e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-232ENST00000469434 583 ntTSL 35.6□□□□□ -1.519e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 ANXA11-210ENST00000481805 793 ntTSL 222.17■■□□□ 1.143e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 NONO-203ENST00000373856 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.223e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 NONO-202ENST00000373841 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.353e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 NONO-215ENST00000535149 2882 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.553e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 NONO-201ENST00000276079 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.643e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 NONO-212ENST00000474431 644 ntTSL 58.5□□□□□ -1.053e-6■■■□□ 14.7
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