Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 TMA7-202ENST00000477624 619 ntTSL 1 (best)22.4■■□□□ 1.181e-8■■■□□ 15.2
UTP3Q9NQZ2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.771e-8■■■□□ 15.2
UTP3Q9NQZ2 TPR-206ENST00000481347 2727 ntTSL 511.99□□□□□ -0.493e-9■■■□□ 15.2
UTP3Q9NQZ2 SPAG9-216ENST00000513827 728 ntTSL 28.82□□□□□ -16e-6■■■□□ 15.1
UTP3Q9NQZ2 SAMSN1-205ENST00000493640 282 ntTSL 38.18□□□□□ -1.16e-6■■■□□ 15.1
UTP3Q9NQZ2 NCL-203ENST00000417652 568 ntTSL 47.39□□□□□ -1.238e-8■■■□□ 15.1
UTP3Q9NQZ2 NCL-206ENST00000454824 606 ntTSL 37.39□□□□□ -1.238e-8■■■□□ 15.1
UTP3Q9NQZ2 TPR-208ENST00000492973 453 ntTSL 29.86□□□□□ -0.831e-8■■■□□ 15.1
UTP3Q9NQZ2 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.86□□□□□ -1.793e-12■■■□□ 15.1
UTP3Q9NQZ2 RBM39-208ENST00000416108 577 ntTSL 49.03□□□□□ -0.962e-6■■■□□ 15.1
UTP3Q9NQZ2 RBM39-220ENST00000455343 441 ntTSL 55.47□□□□□ -1.532e-6■■■□□ 15.1
UTP3Q9NQZ2 AARS-204ENST00000566969 610 ntTSL 210.6□□□□□ -0.712e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 BCL2L1-205ENST00000422920 1157 ntTSL 226.8■■□□□ 1.886e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.496e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.276e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.976e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 AKAP8L-209ENST00000595879 790 ntTSL 319.96■□□□□ 0.796e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 AKAP8L-212ENST00000596750 906 ntTSL 319.12■□□□□ 0.656e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 BCL2L1-209ENST00000456404 914 ntTSL 218.69■□□□□ 0.586e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.576e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 EXO1-203ENST00000423131 950 ntTSL 517.76■□□□□ 0.436e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.316e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.256e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.166e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.096e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 TAF12-204ENST00000495422 624 ntTSL 514.8□□□□□ -0.046e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.056e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 QPRT-204ENST00000564967 2199 nt14.36□□□□□ -0.116e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 PABPN1-205ENST00000555295 406 ntTSL 313.59□□□□□ -0.231e-10■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 VAT1-206ENST00000589709 570 ntTSL 412.88□□□□□ -0.356e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 BCL2L1-207ENST00000439267 781 ntTSL 212.59□□□□□ -0.396e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 MACF1-212ENST00000469366 460 ntTSL 312.54□□□□□ -0.46e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 NCAPD2-204ENST00000536090 654 ntTSL 212.25□□□□□ -0.456e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 MACF1-217ENST00000480624 642 ntTSL 312.19□□□□□ -0.466e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 CCDC47-206ENST00000584112 588 ntTSL 211.72□□□□□ -0.536e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 PABPN1-203ENST00000553960 817 ntTSL 211.5□□□□□ -0.571e-10■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 BCL2L1-204ENST00000420488 820 ntTSL 211.18□□□□□ -0.626e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 EXO1-202ENST00000366548 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.676e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 AFDN-220ENST00000511503 1257 ntTSL 210.82□□□□□ -0.686e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 MACF1-222ENST00000494012 667 ntTSL 410.65□□□□□ -0.76e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 AFDN-222ENST00000515794 746 ntTSL 310.65□□□□□ -0.76e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 EXO1-210ENST00000519225 583 ntTSL 410.65□□□□□ -0.76e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 PABPN1-208ENST00000557702 778 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.811e-10■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 AFDN-214ENST00000486649 423 ntTSL 29.89□□□□□ -0.836e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.936e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 SGMS1-211ENST00000626236 1013 ntTSL 1 (best)9.18□□□□□ -0.946e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC9.03□□□□□ -0.966e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 AFDN-213ENST00000485634 606 ntTSL 28.98□□□□□ -0.976e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 PGRMC2-202ENST00000394276 2858 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.996e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.056e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 VAT1-207ENST00000589828 521 ntTSL 28.37□□□□□ -1.076e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 TAF12-203ENST00000471683 844 ntTSL 38.2□□□□□ -1.16e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 SGMS1-201ENST00000361543 1096 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.116e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.256e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 EXO1-212ENST00000523590 621 ntTSL 56.63□□□□□ -1.356e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 SGMS1-207ENST00000602619 461 ntTSL 35.38□□□□□ -1.556e-6■■■□□ 15
UTP3Q9NQZ2 TXNIP-202ENST00000486597 509 ntTSL 25.08□□□□□ -1.63e-6■■■□□ 14.9
UTP3Q9NQZ2 TMA7-203ENST00000479126 688 ntTSL 222.45■■□□□ 1.181e-8■■■□□ 14.9
UTP3Q9NQZ2 EPB41-211ENST00000488277 262 ntTSL 34.81□□□□□ -1.645e-10■■■□□ 14.9
UTP3Q9NQZ2 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.228e-9■■■□□ 14.8
UTP3Q9NQZ2 HMGB2-205ENST00000511316 1841 ntTSL 213.25□□□□□ -0.298e-9■■■□□ 14.8
UTP3Q9NQZ2 HMGB2-201ENST00000296503 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.348e-9■■■□□ 14.8
UTP3Q9NQZ2 ADH5-210ENST00000512621 1475 ntTSL 213.19□□□□□ -0.35e-8■■■□□ 14.8
UTP3Q9NQZ2 ADH5-212ENST00000512991 880 ntTSL 511.39□□□□□ -0.595e-8■■■□□ 14.8
UTP3Q9NQZ2 ADH5-204ENST00000503130 786 ntTSL 310.43□□□□□ -0.745e-8■■■□□ 14.8
UTP3Q9NQZ2 PDHA1-202ENST00000379804 709 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.065e-8■■■□□ 14.8
UTP3Q9NQZ2 PDHA1-210ENST00000481733 437 ntTSL 27□□□□□ -1.295e-8■■■□□ 14.8
UTP3Q9NQZ2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.41e-6■■■□□ 14.8
UTP3Q9NQZ2 PFN1-202ENST00000572383 539 ntTSL 319.43■□□□□ 0.72e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.632e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-244ENST00000495463 501 ntTSL 430.34■■■□□ 2.459e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-234ENST00000475474 749 ntTSL 227.75■■■□□ 2.039e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-238ENST00000482304 740 ntTSL 226.79■■□□□ 1.889e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-227ENST00000462147 576 ntTSL 426.26■■□□□ 1.799e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-216ENST00000434955 480 ntTSL 324.33■■□□□ 1.499e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-209ENST00000411484 561 ntTSL 423.39■■□□□ 1.339e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-217ENST00000436795 775 ntTSL 523.39■■□□□ 1.339e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-215ENST00000429791 724 ntTSL 423.08■■□□□ 1.299e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-231ENST00000469175 486 ntTSL 322.68■■□□□ 1.229e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-210ENST00000420786 539 ntTSL 521.17■□□□□ 0.989e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-218ENST00000437066 574 ntTSL 418.71■□□□□ 0.599e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-242ENST00000492978 775 ntTSL 318.51■□□□□ 0.559e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-235ENST00000475823 371 ntTSL 311.93□□□□□ -0.59e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-224ENST00000457335 570 ntTSL 411.12□□□□□ -0.639e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-212ENST00000425899 738 ntTSL 511□□□□□ -0.659e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-214ENST00000428524 644 ntTSL 510.7□□□□□ -0.79e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-230ENST00000467971 571 ntTSL 210.23□□□□□ -0.779e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-219ENST00000441533 372 ntTSL 58.55□□□□□ -1.049e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-207ENST00000407017 650 ntTSL 48.06□□□□□ -1.129e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-221ENST00000445030 575 ntTSL 38.06□□□□□ -1.129e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-233ENST00000473479 659 ntTSL 27.59□□□□□ -1.199e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-241ENST00000484740 563 ntTSL 36.67□□□□□ -1.349e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-220ENST00000443492 558 ntTSL 56.37□□□□□ -1.399e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT2-232ENST00000469434 583 ntTSL 35.6□□□□□ -1.519e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 ANXA11-210ENST00000481805 793 ntTSL 222.17■■□□□ 1.143e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 NONO-203ENST00000373856 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.223e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 NONO-202ENST00000373841 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.353e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 NONO-215ENST00000535149 2882 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.553e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 NONO-201ENST00000276079 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.643e-6■■■□□ 14.7
UTP3Q9NQZ2 NONO-212ENST00000474431 644 ntTSL 58.5□□□□□ -1.053e-6■■■□□ 14.7
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