Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RCAN3Q9UKA8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RCAN3Q9UKA8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms