Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
POLKQ9UBT6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLKQ9UBT6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms