Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL9Q9P2J3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms