Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRQ5

SMCO4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO4Q9NRQ5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMCO4Q9NRQ5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms