Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEMA4BQ9NPR2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA4BQ9NPR2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms