Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC90BQ9GZT6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms