Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB7

SPATA16, Spermatogenesis-associated protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA16Q9BXB7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SPATA16Q9BXB7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPATA16Q9BXB7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms