Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF559Q9BR84 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF559Q9BR84 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF559Q9BR84 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF559Q9BR84 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF559Q9BR84 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF559Q9BR84 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF559Q9BR84 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF559Q9BR84 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF559Q9BR84 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF559Q9BR84 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF559Q9BR84 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF559Q9BR84 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF559Q9BR84 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms