Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTRQ99707 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTRQ99707 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTRQ99707 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MTRQ99707 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTRQ99707 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTRQ99707 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTRQ99707 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTRQ99707 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTRQ99707 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTRQ99707 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTRQ99707 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTRQ99707 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTRQ99707 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTRQ99707 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTRQ99707 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTRQ99707 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTRQ99707 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTRQ99707 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTRQ99707 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTRQ99707 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTRQ99707 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTRQ99707 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTRQ99707 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTRQ99707 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTRQ99707 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTRQ99707 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTRQ99707 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTRQ99707 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTRQ99707 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MTRQ99707 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTRQ99707 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MTRQ99707 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTRQ99707 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTRQ99707 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTRQ99707 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTRQ99707 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTRQ99707 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTRQ99707 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTRQ99707 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTRQ99707 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTRQ99707 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTRQ99707 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTRQ99707 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTRQ99707 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTRQ99707 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTRQ99707 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTRQ99707 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTRQ99707 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTRQ99707 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTRQ99707 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MTRQ99707 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MTRQ99707 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MTRQ99707 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTRQ99707 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTRQ99707 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTRQ99707 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTRQ99707 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTRQ99707 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTRQ99707 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTRQ99707 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTRQ99707 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTRQ99707 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTRQ99707 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTRQ99707 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTRQ99707 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTRQ99707 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTRQ99707 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTRQ99707 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTRQ99707 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTRQ99707 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTRQ99707 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTRQ99707 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTRQ99707 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTRQ99707 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRQ99707 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRQ99707 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRQ99707 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRQ99707 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRQ99707 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRQ99707 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRQ99707 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRQ99707 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRQ99707 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRQ99707 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRQ99707 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRQ99707 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRQ99707 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRQ99707 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRQ99707 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRQ99707 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRQ99707 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRQ99707 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRQ99707 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRQ99707 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRQ99707 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRQ99707 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRQ99707 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRQ99707 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRQ99707 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms