Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPR78Q96P69 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPR78Q96P69 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms