Protein–RNA interactions for Protein: Q96N58

ZNF578, Zinc finger protein 578, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF578Q96N58 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF578Q96N58 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF578Q96N58 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF578Q96N58 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms