Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3E2

CCDC186, Coiled-coil domain-containing protein 186, humanhuman

Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC186Q7Z3E2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC186Q7Z3E2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC186Q7Z3E2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms