Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PXDC1Q5TGL8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms