Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
UBAP2Q5T6F2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBAP2Q5T6F2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBAP2Q5T6F2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBAP2Q5T6F2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBAP2Q5T6F2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBAP2Q5T6F2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBAP2Q5T6F2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBAP2Q5T6F2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBAP2Q5T6F2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBAP2Q5T6F2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBAP2Q5T6F2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBAP2Q5T6F2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBAP2Q5T6F2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBAP2Q5T6F2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBAP2Q5T6F2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBAP2Q5T6F2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBAP2Q5T6F2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBAP2Q5T6F2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBAP2Q5T6F2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBAP2Q5T6F2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBAP2Q5T6F2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBAP2Q5T6F2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBAP2Q5T6F2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBAP2Q5T6F2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBAP2Q5T6F2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBAP2Q5T6F2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBAP2Q5T6F2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBAP2Q5T6F2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms