Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC122Q5T0U0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms