Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf116Q5BN46 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf116Q5BN46 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf116Q5BN46 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf116Q5BN46 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf116Q5BN46 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C9orf116Q5BN46 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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C9orf116Q5BN46 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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C9orf116Q5BN46 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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C9orf116Q5BN46 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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C9orf116Q5BN46 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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C9orf116Q5BN46 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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C9orf116Q5BN46 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf116Q5BN46 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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C9orf116Q5BN46 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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C9orf116Q5BN46 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf116Q5BN46 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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C9orf116Q5BN46 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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C9orf116Q5BN46 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf116Q5BN46 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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C9orf116Q5BN46 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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C9orf116Q5BN46 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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C9orf116Q5BN46 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
C9orf116Q5BN46 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
C9orf116Q5BN46 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf116Q5BN46 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf116Q5BN46 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf116Q5BN46 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf116Q5BN46 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf116Q5BN46 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf116Q5BN46 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf116Q5BN46 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf116Q5BN46 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf116Q5BN46 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf116Q5BN46 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf116Q5BN46 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf116Q5BN46 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf116Q5BN46 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf116Q5BN46 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf116Q5BN46 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf116Q5BN46 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf116Q5BN46 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf116Q5BN46 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf116Q5BN46 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf116Q5BN46 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf116Q5BN46 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf116Q5BN46 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
C9orf116Q5BN46 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
C9orf116Q5BN46 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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