Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC6LQ2NKX8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERCC6LQ2NKX8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms