Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPP1R3AQ16821 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPP1R3AQ16821 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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