Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPE65Q16518 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPE65Q16518 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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