Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PSMD6Q15008 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSMD6Q15008 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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