Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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PMS2P3Q13401 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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PMS2P3Q13401 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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PMS2P3Q13401 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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PMS2P3Q13401 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PMS2P3Q13401 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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PMS2P3Q13401 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PMS2P3Q13401 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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PMS2P3Q13401 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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PMS2P3Q13401 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PMS2P3Q13401 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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PMS2P3Q13401 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PMS2P3Q13401 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PMS2P3Q13401 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PMS2P3Q13401 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PMS2P3Q13401 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PMS2P3Q13401 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PMS2P3Q13401 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PMS2P3Q13401 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PMS2P3Q13401 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PMS2P3Q13401 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PMS2P3Q13401 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PMS2P3Q13401 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PMS2P3Q13401 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PMS2P3Q13401 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PMS2P3Q13401 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PMS2P3Q13401 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PMS2P3Q13401 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PMS2P3Q13401 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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