Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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CDK5R2Q13319 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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CDK5R2Q13319 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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CDK5R2Q13319 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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CDK5R2Q13319 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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CDK5R2Q13319 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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CDK5R2Q13319 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDK5R2Q13319 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5R2Q13319 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK5R2Q13319 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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