Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.126e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.156e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.176e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 NAP1L4-206ENST00000469089 707 ntTSL 313.95□□□□□ -0.186e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 MIB2-209ENST00000477990 2821 ntTSL 213.2□□□□□ -0.36e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.316e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 SHISA5-211ENST00000460758 1297 ntTSL 1 (best)12.81□□□□□ -0.366e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 CASKIN1-203ENST00000564289 193 ntTSL 312.66□□□□□ -0.386e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.416e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 MEF2C-AS1-209ENST00000513704 563 ntTSL 412.46□□□□□ -0.416e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 PAPLN-207ENST00000555123 4108 ntTSL 1 (best)12.2□□□□□ -0.466e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 PAPLN-208ENST00000555445 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.486e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 TCAF1-202ENST00000392900 2513 ntTSL 212□□□□□ -0.496e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 PAPLN-201ENST00000216658 4182 ntTSL 1 (best)11.86□□□□□ -0.516e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 MEF2C-AS1-205ENST00000509179 388 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.556e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 WDR37-204ENST00000436154 714 ntTSL 311.18□□□□□ -0.626e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 SHISA5-213ENST00000466424 673 ntTSL 211.13□□□□□ -0.636e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 TCAF1-204ENST00000478172 576 ntTSL 410.98□□□□□ -0.656e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 TCAF1-206ENST00000485416 577 ntTSL 410.06□□□□□ -0.86e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 TCAF1-207ENST00000491908 634 ntTSL 29.89□□□□□ -0.836e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 MEF2C-AS1-203ENST00000508718 483 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.836e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 TCAF1-203ENST00000460532 840 ntTSL 29.61□□□□□ -0.876e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 MEF2C-AS1-201ENST00000506665 362 ntTSL 59.47□□□□□ -0.896e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 AC006213.2-201ENST00000587128 2193 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.916e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 MEF2C-AS1-206ENST00000511100 828 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.936e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 TCAF1-201ENST00000355951 3343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.026e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.26e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.366e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.416e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 AC006213.2-202ENST00000591815 504 ntTSL 24.85□□□□□ -1.636e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.646e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 NAA25-202ENST00000547133 421 ntTSL 54.38□□□□□ -1.716e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 ANKRD28-202ENST00000412318 4408 ntTSL 24.14□□□□□ -1.752e-7■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 PHKB-216ENST00000568439 499 ntTSL 33.74□□□□□ -1.816e-8■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 NAP1L1-224ENST00000552056 1981 ntTSL 54.74□□□□□ -1.652e-12■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.761e-7■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 ADGRV1-202ENST00000425867 8141 ntTSL 56.82□□□□□ -1.321e-6■■■■□ 25.8
TARDBPQ13148 DENND4A-208ENST00000568515 2655 ntTSL 220.47■□□□□ 0.872e-6■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 DENND4A-206ENST00000564674 3389 ntTSL 1 (best)17.59■□□□□ 0.412e-6■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.572e-6■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.032e-6■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 RHOBTB3-207ENST00000506959 547 ntTSL 513.13□□□□□ -0.315e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 RHOBTB3-211ENST00000510623 333 ntTSL 25.42□□□□□ -1.545e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 HDAC4-204ENST00000446876 554 ntTSL 414.67□□□□□ -0.061e-6■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 HDAC4-214ENST00000535493 2743 ntTSL 212.77□□□□□ -0.371e-6■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 HDAC4-208ENST00000463007 3158 ntTSL 1 (best)11.85□□□□□ -0.511e-6■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 GRB10-210ENST00000407526 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.625e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 GRB10-209ENST00000406641 2700 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.985e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 FGF13-203ENST00000421460 352 ntTSL 1 (best)7.03□□□□□ -1.282e-6■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 PHF12-212ENST00000583524 1875 ntTSL 1 (best)25.52■■□□□ 1.683e-6■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 PHF12-203ENST00000378879 2963 ntTSL 519.51■□□□□ 0.713e-6■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.543e-6■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.473e-6■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.323e-6■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 PHF12-217ENST00000589176 869 ntTSL 512.15□□□□□ -0.463e-6■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 PHF12-210ENST00000582655 2551 ntTSL 59.9□□□□□ -0.823e-6■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 PHF12-209ENST00000582436 5697 ntTSL 58.06□□□□□ -1.123e-6■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 PHF12-216ENST00000584822 560 ntTSL 48.02□□□□□ -1.133e-6■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.445e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 HSPBP1-204ENST00000585927 666 ntTSL 525.74■■□□□ 1.712e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.432e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 HSPBP1-207ENST00000587959 424 ntTSL 523.47■■□□□ 1.352e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.332e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.162e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.112e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.072e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.052e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 ADAMTSL5-205ENST00000586272 735 ntTSL 320.9■□□□□ 0.942e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.742e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 CTBP1-211ENST00000511907 900 ntTSL 319.51■□□□□ 0.712e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 ADAMTSL5-203ENST00000585700 1562 ntTSL 1 (best)19.41■□□□□ 0.72e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 CTBP1-205ENST00000504092 920 ntTSL 519.34■□□□□ 0.692e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 ADAMTSL5-208ENST00000590440 1602 ntTSL 1 (best)19.25■□□□□ 0.672e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 FAM49B-217ENST00000520254 579 ntTSL 418.8■□□□□ 0.62e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 FAM49B-208ENST00000518344 554 ntTSL 318.54■□□□□ 0.562e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.522e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.492e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 ADAMTSL5-209ENST00000590562 573 ntTSL 417.38■□□□□ 0.372e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.342e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.332e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 CTBP1-207ENST00000505826 657 ntTSL 516.64■□□□□ 0.252e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 FAM49B-216ENST00000520204 699 ntTSL 516.63■□□□□ 0.252e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.22e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 CTBP1-210ENST00000510739 774 ntTSL 316.09■□□□□ 0.172e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 FAM49B-211ENST00000519070 561 ntTSL 315.85■□□□□ 0.132e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.082e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.072e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 FAM49B-215ENST00000519824 3798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.52e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 FAM49B-220ENST00000522250 1647 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.512e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 MIR4442-201ENST00000583412 67 ntBASIC10.73□□□□□ -0.692e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 SLMAP-203ENST00000383718 6749 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.942e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 SLMAP-214ENST00000467901 2698 ntTSL 26.83□□□□□ -1.322e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.342e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.522e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.542e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.652e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 RAB5A-206ENST00000469122 918 ntTSL 26.25□□□□□ -1.411e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.776e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.616e-7■■■■□ 25.7
TARDBPQ13148 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.616e-7■■■■□ 25.7
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