Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKCDQ05655 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKCDQ05655 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms