Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
BNC1Q01954 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BNC1Q01954 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BNC1Q01954 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BNC1Q01954 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BNC1Q01954 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms